Trên biển Địa Trung Hải mênh mông, một chiếc tàu đánh cá nhỏ bé đã vớt được một người đàn ông đang trôi dạt trên sóng nước. Khi được cứu sống, anh ta hoàn toàn mất trí nhớ, không biết mình là ai, từ đâu đến, hay đã trải qua những gì. Manh mối duy nhất về quá khứ của anh ta là dòng chữ địa chỉ một ngân hàng Thụy Sĩ được phát ra từ con chip laser cấy dưới da. Mang theo ký ức mơ hồ và manh mối bí ẩn, người đàn ông lên đường đến Thụy Sĩ. Tại đây, anh ta đối mặt với vô số thử thách và câu hỏi hóc búa. Ai là người đã cấy con chip vào người anh ta? Dòng chữ địa chỉ ngân hàng ẩn chứa bí mật gì? Quá khứ của anh ta là gì và điều gì đã khiến anh ta mất trí nhớ?...

Hai năm trôi qua êm đềm như mơ kể từ khi chương trình Treadstone sụp đổ. Jason Bourne tưởng chừng đã tìm được hạnh phúc bên Marie, người bạn gái xinh đẹp. Tuy nhiên, ký ức về thân phận điệp viên CIA năm xưa vẫn luôn ẩn hiện trong tâm trí anh như những mảnh ghép rời rạc, thi thoảng lại hiện về qua những hình ảnh kinh hoàng mà anh không thể lý giải. Trên đường phố đông đúc, Jason bỗng nhận ra mình đang bị theo dõi bởi một khuôn mặt gợi nhớ về dự án Treadstone. Linh cảm nguy hiểm mách bảo, anh cùng Marie tìm cách trốn thoát. Nào ngờ, trong cuộc truy sát tàn khốc, bi kịch ập đến: Marie đã hy sinh, còn Jason may mắn sống sót nhưng buộc phải lặn biệt tăm.Chôn vùi nỗi đau tột cùng vào đáy lòng, Jason tiêu hủy mọi giấy tờ tùy thân và hình ảnh, rồi lặng lẽ bay đến châu Âu. Mang theo quyết tâm tìm kiếm sự thật về quá khứ, anh bước vào hành trình mới đầy gian nan và nguy hiểm....