Thế giới trong tương lai bị tàn phá nặng nề bởi loài sinh vật được gọi là Kaiju. Nhật Bản là quốc gia chịu thiệt hại nặng nề nhất, nên họ đã thành lập Lực lượng Phòng vệ để gồm những thành viên có thể chất vượt trội nhất để bảo vệ đất nước. Nhân vật chính Kafka Hibino luôn khao khát được gia nhập vào Lực lượng Phòng vệ. Thế nhưng vì anh trượt bài kiểm tra đầu vào liên tục nên chỉ có thể làm người dọn xác quái vật. Trong một lần làm nhiệm vụ, anh vô tình bị một con Kaiju chui vào miệng, nó đã biến anh thành một Kaiju hình người có sức mạnh khủng khiếp....