Phim Ở Nhà Một Mình 3 kể về một vụ con chip máy tính bị bốn tên trộm quốc tế ăn cắp của công ty máy tính. Chúng đã giấu trong chiếc xe ô tô đồ chơi và bà Hess khi ra sân bay ở San Fansisco đã lấy nhầm túi. Khi đến Chicago, bà lên chiếc taxi trở về trung tâm thành phố và bị một tên chụp biển số xe. Sau khi chú bé Alex dọn tuyết xong, bà không trả tiền công mà lại trả cho chú chiếc xe đồ chơi của bọn trộm và cầm về nhà. Bọn chúng ngơ ngác vì nhà nào cũng giống nhau nên không tìm ra được....

Hiện tượng siêu nhiên lại bắt đầu với một thế hệ anh hùng mới đầy cảm hứng, những người bước vào cuộc chiến cuối cùng giữa những người có khả năng phi thường và những kẻ có động cơ đen tối, săn lùng và khai thác sức mạnh của họ. Những cuộc phiêu lưu sử thi đang chờ đợi những đồng minh mới được trao quyền này khi họ chạm trán với một số nhân vật gốc, mở khóa số phận bí ẩn của vũ trụ và vị trí của họ trong đó....